Youkai'lerin, hayvanların ve bazı insanların yaşadığı, dünyamızdan sihirli bir bariyerle tamamen ayrılmış büyüleyici Gensokyo dünyasına hoş geldiniz. İki dünya arasındaki tek geçit Hakurei tapınağıdır. Reimu Hakurei, söz konusu tapınakta çalışan kızdır. Ne zaman doğaüstü nedenlerden kaynaklanan sorunlar ortaya çıksa, Reimu arkadaşlarıyla birlikte araştırmak, nedeni ortadan kaldırmak ve Gensokyo'yu yeniden dengeye getirmek için dışarı çıkar.